Gautham Menon studierte Maschinenbau am Mookambigai College of Engineering und schloss sein Studium 1993 ab. Seine Zeit dort inspirierte ihn dazu, seine Hauptfiguren in Minnale und Vaaranam Aayiram als Studenten desselben Studiengangs zu gestalten. Er behauptet, von Filmen wie Der Club der toten Dichter und Nayagan inspiriert worden zu sein, und drückte seinen Eltern seinen Wunsch aus, den Karriereweg zu wechseln und Filmemacher zu werden.

Daraufhin schrieb er sein erstes Drehbuch in seinem College-Wohnheim. Seine Mutter bestand darauf, dass er Werbefilmer wurde, indem er verschiedene Werbespots drehte, und er absolvierte eine Ausbildung bei dem Filmemacher Rajiv Menon. Anschließend arbeitete er 1997 als Regieassistent für Minsaara Kanavu, in dem er auch einen Cameo-Auftritt hatte.