Gautham Menon fue estudiante de ingeniería mecánica en el Mookambigai College of Engineering y se graduó en la promoción de 1993, y su tiempo allí lo inspiró a hacer que sus personajes principales de Minnale y Vaaranam Aayiram fueran estudiantes del mismo curso. Afirma haberse inspirado en películas como Dead Poet's Society y Nayagan y expresó a sus padres su deseo de cambiar de carrera y convertirse en cineasta, y en consecuencia escribió su primera película en el hostal de su universidad.

Su madre insistió en que se convirtiera en realizador de anuncios filmando diversos comerciales y realizó un aprendizaje con el cineasta Rajiv Menon. Posteriormente trabajó como asistente de dirección en Minsaara Kanavu en 1997, en la que también apareció en un papel cameo.