Гаутам Менон навчався на механічному факультеті Інженерного коледжу Мукамбігай і закінчив його в 1993 році; час, проведений там, надихнув його зробити головних героїв фільмів «Міннале» та «Вааранам Аайірам» студентами тієї ж спеціальності. Він стверджує, що надихався такими фільмами, як «Товариство мертвих поетів» і «Наяган», і висловив батькам бажання змінити кар'єрний шлях і стати кінорежисером, а згодом написав свій перший фільм у гуртожитку коледжу.

Його мати наполягла, щоб він став режисером рекламних роликів, знімаючи різні рекламні ролики, і він пройшов стажування під керівництвом режисера Раджива Менона. Згодом він працював асистентом режисера на фільмі «Мінсаара Канаву» у 1997 році, де також з'явився в епізодичній ролі.