Ilya Shakunov okul yıllarında ünlü aktör Igor Gorbachev'in stüdyosunda çalıştı. Okulu bitirdikten sonra Sankt-Peterburg Tıp Enstitüsü'ne girdi, ardından V. I. Ulyanov (Lenin) adına Leningrad Elektroteknik Enstitüsü'nün otomasyon ve bilgisayar teknolojisi fakültesine geçti. Ancak bir süre sonra enstitüyü bıraktı ve Leningrad Devlet Tiyatro, Müzik ve Sinematografi Enstitüsü sınavlarına girdi.

Tiyatro enstitüsünde Veniamin Filştinski'nin sınıfında okudu. 1996'da LGITMiK'ten mezun oldu. Leningrad Gençlik Tiyatrosu'nun sanat yönetmeni Andrey Andreyev'in davetiyle bu tiyatronun kadrosuna katıldı. Gençlik Tiyatrosu'nun yanı sıra Roman Viktyuk'un oyunlarında da rol aldı. 1993'te sinemada oynamaya başladı. 2002'den itibaren "Brat" prodüksiyon merkezinin oyuncu ajansının başkanıdır.