Джон Джейкобс родился в Дербишире, Англия, но вырос в Лондоне. Его мать Джеки Уайт была мисс Великобритания в 1961 году, его отец Адриан Джейкобс был печально известным финансистом 60-х. Он бросил школу в возрасте 10 лет, чтобы полностью посвятить себя изучению актёрского мастерства в театральной школе. Среди его друзей-подростков были звезда Шарлотта Льюис («Золотой ребёнок» (1986)) и поп-звезда новой волны Анабелла из Bow Wow Wow.

В 1981 году его исключили из знаменитой британской театральной школы Сильвии Янг. В 1986 году он начал снимать собственные фильмы, чтобы играть в них, начиная с «Салетт», затем последовали «Метрополис Апокалипсис» и «Лунное воскресение» в 1987 году. «Метрополис Апокалипсис» был официальным отбором Каннского кинофестиваля в 1988 году. В 1991 году он переехал в Лос-Анджелес и стал плодовитым в инди-андерграунде.