Кристен Джонстон изучала актёрское мастерство в Актёрской школе Atlantic Theater Company в Нью-Йорке.

Она получила две премии «Эмми» за роль в сериале «Третья планета от Солнца» (1996). Она появлялась во многих других телесериалах, включая «Дурнушку Бетти» (2006), «Скорую помощь» (1994), «Скучаю по тебе» (2009) и, пожалуй, наиболее запомнилась как тусовщица, чьими знаменитыми последними словами были «Мне так скучно, что я могла бы умереть» в сериале «Секс в большом городе» (1998). В настоящее время она снимается на телевидении в популярном сериале канала TV Land «Бывшие» (2011), который сейчас идёт четвёртый сезон. Среди многих театральных работ Джонстон — «So Help Me God!» (номинация на Drama Desk), «Женщины», «Тётя Дэн и Лемон», «Love Song» в Вест-Энде, а также главные роли в трёх постановках «Шекспир в Центральном парке»: «Много шума из ничего», «Двенадцатая ночь» и «Кожа наших зубов». Она является давним членом Atlantic Theater Company, и её роли за эти годы включали «The Lights» (номинация на Drama Desk) и «Scarcity». Среди киноработ Кристен — «Остин Пауэрс: Шпион, который меня соблазнил» (1999), второй фильм об Остине Пауэрсе (в роли «Иваны Хампалот»), «В поисках блаженства» (2009), «Плохие родители» (2012), «Война невест» (2009), «Жизнь случается» (2011), «Вампиры» (2012), «Незнакомцы с конфеткой» (2005) и предстоящий независимый фильм «Lovesick» (2014) с Мэттом Лебланом. Джонстон преподаёт актёрское мастерство в Актёрской школе Atlantic Theater Company при Нью-Йоркском университете. Она основала организацию SLAM, целью которой является создание столь необходимой трезвой средней школы в Нью-Йорке. Первая книга Джонстон — мемуары, ставшие бестселлером по версии New York Times, под названием «GUTS: the endless follies and tiny triumphs of a giant disaster».