John Donkin a été nommé aux Oscars en 2003 en tant que producteur de Gone Nutty, un court métrage d'animation créé chez Blue Sky Studios mettant en scène le personnage populaire Scrat des films « L'Âge de glace ». Donkin a rejoint Blue Sky Studios en 1998 comme directeur technique et administratif. L'un de ses premiers projets a été d'aider à achever le court métrage oscarisé Bunny. Il a développé la chaîne de production du premier long métrage d'animation de Blue Sky, L'Âge de glace, avant de devenir producteur associé sur le film. Donkin a ensuite produit plusieurs autres projets de Blue Sky Studios, dont Rio et Rio 2, qui sont devenus une franchise mondialement réussie, L'Âge de glace 3 : Le temps des dinosaures, qui a rapporté plus de 887 millions de dollars dans le monde, L'Âge de glace 4 : La dérive des continents, Robots, et le court métrage nommé aux Oscars No Time for Nuts.

Donkin a commencé sa carrière dans l'animation par ordinateur en 1983, où il a étudié avec le CGRG (Computer Graphics Research Group) de renommée mondiale à l'Ohio State University. Il est ensuite devenu animateur principal dans l'entreprise pionnière d'infographie Cranston/Csuri Productions.